Фамилия Васильчикова — классический пример русской фамилии, образованной от канонического имени. В её основе лежит уменьшительная форма Васильчик от крестильного имени Василий (греч. basileus — «царь, царственный»). Суффикс -чик в данном случае не профессиональный (как в словах «лётчик» или «переплётчик»), а уменьшительно-ласкательный: так в быту могли называть человека по имени Василий, особенно в юном возрасте или в кругу близких. Фамилия закрепилась в форме притяжательного прилагательного с суффиксом -ов-: Васильчиков, а для женщин — Васильчикова.

Русское дворянство знает род Васильчиковых, чья родословная по семейному преданию восходит к легендарному Индрису (Тенгрису), принявшему в XIV веке православие с именем Леонтий. Согласно родословию, его потомок Андрей Харитонович по прозванию Толстой перешёл на службу к великому князю Василию Тёмному в Москву. От его внуков пошли сразу несколько известных фамилий: старший внук, Фёдор Карпович Большой Толстой, стал родоначальником графов и дворян Толстых; младший, Федец, дал начало Федцовым; а Юрий Карпович, внук Андрея, имел единственного сына Василия по прозванию Дурной. У Василия Дурного было три сына: Микула (от него пошли Дурновы), Данила (Даниловы) и третий — Василий, которого в семье называли уменьшительно Васильчик. Именно он считается прямым родоначальником Васильчиковых.

Таким образом, фамилия образована не напрямую от полного имени Василий, а от его обиходной домашней формы. Модель «имя + суффикс -чик + фамильный суффикс -ов» — довольно редкая для дворянских родов: обычно знатные фамилии образовывались от полных имён (Васильев) или от прозвищ. Форма Васильчиков указывает на то, что прозвание Васильчик закрепилось за конкретным человеком и перешло к его потомкам уже как родовое имя.

С точки зрения словообразования фамилия Васильчикова стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Ива́нчиков (от Иванчик), Петру́нчиков, Степа́нчиков. Все они образованы по одной схеме: уменьшительное имя на -чик плюс суффикс -ов. Однако если фамилии вроде Ива́нчиков встречаются довольно часто, то Васильчиков — вариант более редкий, с ярко выраженной «домашней» окраской исходного прозвища.