Фамилия Василюгин образована от имени или прозвища, в основе которого лежит крестильное имя Василий. В отличие от более привычных отчеств на -ов/-ев или -ин, здесь использован редкий суффикс -югин. Такая модель встречается в русских фамилиях нечасто и обычно указывает на непринуждённую, разговорную или даже пренебрежительно-снизительную форму имени. Суффикс -юг(а) в дореволюционной речи придавал слову оттенок грубоватости или просторечия: «Васюга» — это нечто вроде «Васька», но с более резким звучанием. Соответственно, Василюгин — буквально «сын Васюги», то есть потомок человека, которого в быту называли не Василием и не Васей, а именно Васюгой.

Поскольку имя Василий было одним из самых распространённых на Руси (в святцах оно встречается десятки раз), фамилии от него возникали повсеместно. Однако вариант Василюгин — сравнительно редкий. Его география может быть связана с северными или центральными губерниями России, где диалектные формы имён дольше сохранялись в обиходе. В сословном отношении носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьян или посадских людей: в дворянской среде предпочитали более «благозвучные» формы вроде Васильевых.

Любопытно, что суффикс -югин встречается и в других фамилиях от имён: например, Ивашюгин, Петрюгин, Митрюгин. Все они построены по одной модели: основа — просторечный вариант имени (Ивашюга, Петрюга), а затем притяжательный суффикс -ин. Таким образом, Василюгин стоит в ряду нестандартных, но типологически однородных фамилий, которые сохранили живую народную речь XVII–XVIII веков. Если сравнивать её с однокоренной фамилией Васильев, то Василюгин звучит куда более «домашне» и, вероятно, возникла она в среде, где отчества ещё не успели застыть в официальной форме.

В современной России фамилия встречается, но не входит в число распространённых. Из-за редкости и необычного суффикса она часто привлекает внимание при чтении старых метрических книг или списков переселенцев.