Фамилия Вассунов — редкий случай, когда за основу взято не полное каноническое имя, а его сокращённая, почти «домашняя» форма. Корень здесь — Вассун, производное от крестильного имени Василий. В русской традиции имя Василий (от греческого «басилевс» — царь) давало десятки уменьшительных вариантов: Вася, Васюта, Васюня, а также Вассун. Суффикс -ун в данном случае — не фамильный, а словообразовательный: он придавал имени оттенок ласкательности или просторечности, как в парах «Иван — Иванюн», «Пётр — Петрун». Таким образом, Вассуном в быту могли звать человека по имени Василий, причём форма довольно редкая и, возможно, региональная.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: к основе Вассун добавили притяжательный суффикс -ов, который изначально отвечал на вопрос «чей?». Вассунов буквально означало «сын Вассуна» или «потомок Вассуна». Суффикс -ов, а не -ин, указывает на то, что исходное имя или прозвище оканчивалось на твёрдый согласный (Вассун), что типично для северных и центральных регионов России.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям — встречается в документах по Воронежской, Курской и Ростовской областям, что косвенно подтверждает её происхождение от диалектного или простонародного варианта имени. В центральных губерниях чаще использовали формы Васин или Васькин, а Вассунов остался на периферии, что делает его ценным маркером миграции крестьянского населения.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с греческим словом «вассос» (глубина) или с тюркским корнем «вас» (друг, товарищ). Но она не выдерживает критики — ни в одном из известных ономастиконов (ни у Унбегауна, ни у Никонова) не зафиксировано подобных заимствований в русских фамилиях. Куда реалистичнее, что Вассунов — это простонародный вариант фамилии Васильев, но с сохранением редкой уменьшительной формы, которая не прижилась в литературном языке.

В сословном плане носители фамилии, скорее всего, принадлежали к крестьянству или мещанству: дворянские роды предпочитали более «благородные» окончания (-ский, -цкий) или полные формы имени. Фамилия не фиксируется в родословных книгах, что подтверждает её «низовое» происхождение. Сегодня Вассуновы — немногочисленная, но живая фамилия, сохранившая в своей основе ту самую бытовую ласку, с которой в русской деревне обращались к человеку по имени Василий.