Фамилия Вавиленков образована от мужского крестильного имени Вавила. В переводе с арамейского оно означает «ворота Бога» или «житель Вавилона». Покровителем этого имени считается Святой великомученик Вавила, епископ Антиохийский, ревностный последователь христианства. В основе фамилии лежит не само имя, а его производная форма — Вавиленко. Такая модель на -енко характерна для украинской и белорусской традиции: в этих землях имя Вавила превратили в фамилию Вавиленко, что буквально значит «потомок Вавилы». Со временем, вероятно, род Вавиленко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии с помощью «великорусского» суффикса -ов. Так появился Вавиленков — потомок человека по имени Вавила, чьи предки носили украинскую фамилию. Это редкий случай, когда в одной фамилии застыли сразу две модели: сначала южнорусская (-енко), затем северная (-ов).