Фамилия Вайдонов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Вайдонов образована от прозвища Вайдон. По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «вайда» - «ванда, верша», «род растений семьи крестоцветных (вайда заменяет кубовую краску, индиго). Вероятно, прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность основателя фамилии: он мог быть рыбаком или мастером по окраске тканей, кожи и т.п. Согласно другой гипотезе, прозвище восходит к топониму Вайда — город в Германии, в земля Тюрингия. В таком случае предок Вайдоновых мог быть уроженцем или жителем этого населенного пункта. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Вайдон, со временем получил фамилию Вайдонов. О точном месте и времени возникновения фамилии Вайдонов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Вайдонов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.