Фамилия Вайдугов — редкая, и её разбор требует внимания к суффиксу и возможным иноязычным корням. Скорее всего, в основе лежит не славянское, а тюркское или финно-угорское слово, адаптированное русской фамильной моделью.

Первый и главный вопрос — что скрывается за корнем «Вайдуг-». Самая прямая версия отсылает к тюркскому слову «вай» или «бай» (богатый, господин) и «дуг» (родственник, друг). В таком случае Вайдуг — это прозвище или личное имя, означавшее «богатый друг» или «знатный родич». В русской среде такие имена из тюркских языков не редкость, особенно в Поволжье и Приуралье, где фамилия могла возникнуть.

Вторая, менее вероятная версия — от финно-угорского «вай» (сила, мощь) и «дук» (человек). Это могло дать прозвище «силач» или «крепкий мужчина», но такая трактовка менее обоснована, поскольку фамилия не зафиксирована в северных регионах, где сильны финно-угорские языки.

Суффикс «-ов» — типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: Вайдугов — сын Вайдуга. Модель образования стандартна для XIX века, когда фамилии массово закреплялись за крестьянами и мещанами. Значит, предок носителя фамилии был человеком по прозвищу или имени Вайдуг, и его потомки стали Вайдуговыми.

Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в записях из Оренбургской и Самарской губерний, что подтверждает тюркскую версию: эти регионы — зона исторического контакта русских с башкирами, татарами и казахами. Сословно предки могли быть государственными крестьянами или казаками, реже — купцами.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Вайдугин, Вайдуков) показывает, что Вайдугов — самая распространённая форма из этого гнезда, хотя в целом фамилия остаётся штучной. В дореволюционных справочниках она не упоминается, что говорит о её локальном бытовании.