Фамилия Ваюшина — женская форма фамилии Ваюшин, которая образована по самой распространённой русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Ваюшин буквально означало «сын Ваюши» или «человек из семьи Ваюши». Основа фамилии — личное имя или прозвище Ваюша, а вот его происхождение требует разбора.

Скорее всего, Ваюша — это уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Варфоломей (апостол Варфоломей, одно из двенадцати имён). В русской народной традиции длинные имена часто сокращали до простых и удобных: Варфоломей превращался в Варю, Ваню, а в некоторых говорах — в Ваю. Аналогично от имени Афанасий появлялись Афоня и Афоня, а от Варфоломей — Варя и Ваюша. Менее вероятно, но возможно, что основа связана с диалектным глаголом «ваять» (делать, творить) или с редким личным именем Ваюта, но первая версия выглядит надёжнее.

Фамилия Ваюшин — редкая, её очаг бытования, по данным современных справочников, сосредоточен в северных и центральных областях России, особенно в Вологодской и Костромской губерниях. Там имя Варфоломей было в ходу у крестьян, а от него и пошли прозвищные фамилии. Встречаются также варианты Ваюшкин, Ваюгин — они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами.

Сословно фамилия почти наверняка крестьянская или мещанская, без дворянских корней. В документах XVII–XVIII веков Ваюшины упоминаются среди посадских людей и крестьян Северного Приуралья. Носительница фамилии Ваюшина может быть уверена: её предки жили на Русском Севере, а их родоначальника звали Ваюша — скорее всего, Варфоломей, которого в быту называли кратко и тепло.