Фамилия Веденкова образована от имени Веденей — народной, просторечной формы церковного имени Венидикт (в канонической традиции — Венедикт). Латинское Benedictus означает «благословенный», по другой версии — «тот, о ком хорошо говорят». В основе фамилии лежит уменьшительный вариант Веденя, который в крестьянской и рабочей среде был естественнее полного имени. Суффикс -ов в окончании указывает на типичную для русских фамилий модель принадлежности: Веденков буквально значит «сын Ведени» или «из семьи Ведени».

Переход от Веденя к Веденкову — пример того, как просторечная форма имени закрепилась в фамилии, минуя книжный вариант. В говорах имя Венедикт нередко звучало как Веденей, Веденя, отсюда и основа. Со временем род Веденко (без суффикса) мог переехать в Россию, где фамилия русифицировалась добавлением -ов, что характерно для украинских и белорусских переселенцев. Географически фамилия Веденкова встречается в центральных областях России и в Поволжье, что подтверждает её позднее закрепление в русской ономастике.

Интересно, что в говорах фамилию могли путать с однокоренной Ведениной или Веденеевым, но суффикс -ков указывает на более конкретное прозвищное происхождение. В отличие от фамилий на -ин, образованных от основ на -а/-я, здесь мы видим типичную патронимическую модель на -ов, что говорит о формировании фамилии уже после XV века, когда такие формы стали массовыми.