Фамилия Вербкин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: от основы, оканчивающейся на согласный, с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывал на принадлежность: Вербкин буквально означал «сын Вербки» или «человек из рода Вербки». В качестве основы выступало нецерковное, мирское имя Вербка. Такие имена, данные от названий растений, были обычным делом в дохристианской и раннехристианской традиции на Руси. Верба — дерево, которое на Руси почиталось как символ здоровья, быстрого роста и весеннего обновления. Нарекая ребёнка Вербкой, родители вкладывали в имя пожелание, чтобы дитя росло крепким, гибким и жизнестойким, как верба, и чтобы силы природы были к нему благосклонны.

Словообразовательная цепочка здесь прозрачна: Верба → уменьшительно-ласкательное Вербка → фамилия Вербкин. Подобный тип фамилий (Соснин, Дубкин, Осин) встречается повсеместно, но фамилия Вербкин заметно реже своих «древесных» собратьев. Скорее всего, она не получила широкого распространения за пределами тех регионов, где имя Вербка было в ходу как личное. Поскольку мирские имена чаще бытовали в крестьянской и посадской среде, можно предположить, что первые носители фамилии относились к непривилегированным сословиям. Ономасты, в частности Б. Унбегаун в «Русских фамилиях», отмечают, что суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от имён и прозвищ на -а/-я, что полностью соответствует нашему случаю.

Встречаются варианты написания Верпкин (с оглушением звонкого «б» перед глухим «к») — это фонетическая запись, которая могла закрепиться в документах из-за местного говора или неграмотности писаря. Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям, где верба — обычное дерево, а форма имени Вербка была более употребительна. В целом, фамилия Вербкин — яркий пример того, как имя-оберег, связанное с почитанием природы, закрепилось в наследственном родовом прозвании.