Фамилия Вердингис — редкая, и её происхождение неочевидно. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая на стыке культур, а не исконно русская. Её основа — Verdingis — не имеет прямых аналогов в славянских именах или прозвищах. Наиболее правдоподобная версия: фамилия имеет прибалтийское или западно-финское происхождение. В литовском и латышском языках есть корни, связанные с глаголами «вертеть», «поворачивать» (versti, vērst), а также с «детьми» (vaikai, bērni). Однако суффикс -ис (а не -ус или -ас) указывает на то, что фамилия могла быть «олитовлена» или «олатышена» в процессе адаптации.

Если отбросить балтийскую гипотезу, можно предположить немецкое влияние. В немецких диалектах существует фамилия Werding или Werdin, образованная от топонима (например, Верден) или от личного имени (Werdo). Окончание -ис в таком случае — это русская или польская передача немецкого окончания, характерная для остзейских немцев или переселенцев. Носитель фамилии Вердингис мог быть потомком немецкого колониста, чью фамилию переделали на местный лад.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. В русском языке фамилии на -ис почти не встречаются (исключение — единичные случаи вроде Курис). Это ещё один довод в пользу иноязычного происхождения. Фамилия не содержит типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский), поэтому её носители, скорее всего, не были крестьянами центральной России. Сословно можно предположить мещан или мелких дворян западных губерний (Ковенской, Виленской, Курляндской), где смешивались языки и культуры.

Единого значения у фамилии нет. Если основа восходит к балтийскому «вертеть», то прозвище могло относиться к непоседливому, вертлявому человеку или к тому, кто занимался плетением, кручением (например, вить верёвки). Если к немецкому топониму — то фамилия указывает на выходца из конкретного места. Спор между этими версиями решается в пользу балтийской: географически фамилия Вердингис встречается чаще всего в Литве и среди литовцев, живущих в России, а не в Германии.

В написании фамилии возможны варианты: Вердингис, Вердингист, Вердингиз. Двойное «г» (Вердинггис) — ошибка, так как в исходных языках корень короткий. В современной России фамилия остаётся крайне редкой, что делает её уникальной в генеалогическом поиске.