Фамилия Вердийев — редкий случай в русском ономастиконе, и её разбор требует внимания к деталям. Сразу бросается в глаза окончание -ев, которое указывает на русскую модель образования от отчества или прозвища, оканчивающегося на согласный или -й. Но основа «Вердий» не характерна для славянских корней. Здесь, скорее всего, мы имеем дело с фамилией, возникшей на стыке культур.

Наиболее вероятная версия — происхождение от личного имени Вердий, которое, в свою очередь, восходит к латинскому viridis — «зелёный». Это имя могло попасть в русскую среду через южнославянские или румынские языки, где форма Вердиу или Вердий встречается как вариант имени, связанного с цветом или юностью (от лат. viridis также «молодой, свежий»). В таком случае предок носителя фамилии мог быть человеком с прозвищем «Зелёный» — либо по цвету глаз, одежды, либо по молодости и неопытности. В пользу этой гипотезы говорит и то, что в болгарской и молдавской ономастике фамилии на -ев от подобных основ обычны.

Менее вероятна, хотя и возможна, связь с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках есть слово «верди» — «дал» (форма прошедшего времени от глагола «давать»). В этом случае Вердийев могло быть русифицированной формой фамилии вроде Вердиев (от имени Верди — «данный [Богом]»). Однако написание через «й» (Вердийев, а не Вердиев) склоняет скорее к первой, латинской версии: «ий» здесь могло быть искусственно внесено при адаптации фамилии к русскому произношению, чтобы избежать зияния гласных.

Интересно, что фамилия Вердийев почти не встречается в исторических документах и современных базах данных — это указывает на её позднее возникновение (вероятно, не ранее XIX века) и узкую локальную распространённость. Носители могли быть выходцами из южных регионов Российской империи, где смешивались славянские, балканские и тюркские влияния — например, из Бессарабии или Новороссии. Сословно предки, скорее всего, были крестьянами или мещанами, так как дворянские фамилии с такой основой не фиксируются.