Фамилия Вергигора — один из ярких примеров так называемых «говорящих» прозвищ, которые закрепились в качестве родового имени. Её основа — глагол «вергать» (старославянский вариант «вергнуть», то есть бросить, кинуть) и существительное «гора». Буквально прозвище Вергигора означало «сбрасывающий с горы» или «метающий горы». В переносном смысле так могли назвать человека могучего, неуёмного, склонного к разрушению или, наоборот, того, кто работает в горах, обрушивая породу, — например, камнетеса или рудокопа.

Словообразовательная модель здесь необычна для русских фамилий. В ней нет привычного суффикса принадлежности (-ов, -ин, -ский). Фамилия застыла в форме чистого прозвища, что чаще встречается на Украине и в южнорусских землях. Такие фамилии, как Вергигора, Гуляйполе, Непийвода, Перебийнос, — типичные для украинской ономастики. Поэтому с высокой вероятностью корни Вергигор — из среды украинского или белорусского казачества, где ценились яркие, хлёсткие прозвища, подчёркивающие характер или занятие человека.

В русских говорах слово «верзить» означало «делать что-либо небрежно, кое-как», но для фамилии эта версия менее убедительна: конструкция «верги+гора» слишком прозрачна и не даёт повода для иного толкования. Встречаются также варианты написания — Вергигор, Вергигур, что объясняется местными диалектными особенностями произношения.

Фамилия редкая, в списках массовых русских фамилий она не значится. Её носители рассеяны по Украине, югу России и Беларуси. Сословной привязки нет: такое прозвище мог получить как крестьянин-землепашец, так и запорожский казак. В дореволюционных переписях она почти не встречается, что говорит о её поздней письменной фиксации — скорее всего, окончательно закрепилась как наследственная фамилия только к XIX веку.