Фамилия Верниковская — типичный пример «отчества второго порядка», где цепочка родства просматривается почти наглядно: Верниковская — дочь или внучка того, кто был Верниковым, а тот, в свою очередь, потомок человека по прозвищу Верник. Такая модель образования (с суффиксом -ск-) характерна для фамилий польского, украинского и западнорусского происхождения, где женская форма на -ская нередко указывала на принадлежность к роду или поместью, а не просто на замужество. В русской традиции фамилии на -ский закрепились в среде духовенства и дворянства, но Верниковская могла возникнуть и в мещанской или крестьянской среде западных губерний.

Прозвище Верник, лёгшее в основу, многозначно. В древнерусском языке «верник» означало человека, «которому можно безусловно верить», — честного, надёжного. Но у слова был и отчётливый религиозный оттенок: «верник» называли праведника, ревностного верующего. В некоторых говорах так могли обозначить и того, кто присягнул (дал «веру») на верность князю или общине. Поэтому предок-носитель прозвища мог быть либо человеком исключительной честности, либо человеком глубоко церковным, либо даже должностным лицом, принимавшим клятвы.

На письме фамилия встречается в двух вариантах — Верниковская и Верниковская, что связано с колебанием ударения и диалектным произношением. Второй вариант (с ударным «о») встречается реже и, скорее всего, отражает местное аканье или просто описку в документах. Основная масса носителей фамилии исторически сосредоточена в Беларуси и на западе России — в Витебской, Могилёвской и Смоленской губерниях, что подтверждает её западнорусский или белорусский корень.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Верников, Верник, Верницкий) показывает, что Верниковская — самая поздняя по времени образования, возникшая не раньше XVII–XVIII века, когда фамилии на -ский/ -ская стали массово фиксироваться в церковных и ревизских книгах. В отличие от простого Верникова, которое могло появиться уже в XV веке, Верниковская несёт отпечаток более книжной, «официальной» традиции именования.