Фамилия Вейер — редкий для России пример фамилии немецкого происхождения, которая сохранилась в исходном написании и не была русифицирована. В подавляющем большинстве случаев её носители — потомки немецких колонистов, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках по приглашению Екатерины II и Александра I. Фамилия образована от немецкого слова «Weiher» (пруд, запруда) или от топонимов с этим же корнем. В Германии немало населённых пунктов с названием Вейер (Weiher), и фамилия могла закрепиться за выходцем из такого места — по типичной для немецкой ономастики модели «по месту жительства».

Второй вариант происхождения — от профессии или прозвища. Слово «Weiher» в южнонемецких диалектах могло означать не только водоём, но и человека, который следит за прудами или живёт у воды. В отличие от русских фамилий, где суффиксы -ов/-ин сразу указывают на принадлежность («чей?»), немецкая модель Вейер — это чистая основа без добавочных окончаний. Именно поэтому фамилия осталась короткой и легко узнаваемой.

В России фамилия Вейер встречается прежде всего в Поволжье, на Южном Урале и в Сибири — там, где располагались немецкие колонии. После депортации немцев в 1941 году многие носители фамилии оказались в Казахстане и Средней Азии. Сейчас Вейеры живут в основном в Омской, Новосибирской областях, Алтайском крае, а также в Германии среди поздних переселенцев.

Стоит отметить, что в русском языке фамилия склоняется как обычное существительное мужского рода: Вейера, Вейеру, Вейером. У женщин фамилия не склоняется. Встречаются варианты написания Вейер и Вейеръ (до реформы орфографии 1918 года), но основной корень остаётся неизменным.