Фамилия Вилин образована от прозвища Виля. Возможно, прозвище Виля ведет свое начало от нарицательного «вилюга», которое встречается в «Толковом словаре живого великорусского языка» В. Даля в значении «хромой». Это слово было зафиксировано в Курской области. Поэтому можно предположить, что основатель рода Вилиных был уроженцем этих мест. Согласно другой версии, в основе этого прозвища лежит глагол «вилять». В этом случае прозвище могло указывать на особенности походки или характера предка. Наконец, нельзя исключить, что прозвище Виля происходит от слова «вилы», которое имело несколько значений: «орудие, прямой рукояти с двумя и более рожнами или зубьями», «ноги человека, нижняя часть тела», «рот, пасть». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Виля, со временем получил фамилию Вилин.