Фамилия Вилия — редкая и неоднозначная. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён или профессий, её происхождение может уводить в разные языковые и географические стороны. Короткая, звонкая, она не вписывается в привычные модели на -ов или -ин, что сразу наводит на мысль о нестандартном пути возникновения.

Вероятнее всего, фамилия Вилия имеет топонимическое происхождение. Река Вилия (по-белорусски Вілія, по-литовски Neris) — крупный приток Нямунаса, протекающий по территории Беларуси и Литвы. Человек, живший на её берегах или переселившийся оттуда, мог получить прозвище «Вилия», которое затем закрепилось как фамилия. Такая модель характерна для западных регионов Российской империи, особенно для Виленской и Ковенской губерний, где гидронимы часто становились фамилиями без дополнительных суффиксов. Если это так, то предки носителя фамилии были выходцами с берегов этой реки, а сама фамилия — своего рода географический маркер.

Вторая версия, менее распространённая, но возможная, — происхождение от личного имени. Вилия могла быть уменьшительной или разговорной формой от крестильного имени Викентий (через Викентий → Викентий → Виля → Вилия) или от женского имени Виолетта. Однако для русской традиции такие сокращения более характерны для имён на -ий (например, Виталий → Виталик), а форма «Вилия» звучит скорее как западнославянский или балтийский вариант.

Есть и третья, экзотическая гипотеза: фамилия могла возникнуть у народов Поволжья или Приуралья. В тюркских языках слово «вил» или «вилия» может означать «сила», «могущество» (ср. арабское «вилайя» — власть). Но эта связь крайне шаткая и не подкреплена массовыми данными.

Словообразовательно фамилия Вилия стоит особняком. В ней нет типичных русских суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский), что говорит либо о её позднем закреплении (когда фамилии уже давали без изменений, по прозвищу), либо о нерусском корне. Сравните с однокоренными, но уже «обрусевшими» фамилиями: Вильев, Вильин — они встречаются чаще и однозначно указывают на происхождение от имени Виля. Сама же форма «Вилия» осталась без суффикса, что роднит её с такими фамилиями, как Заря, Буря, Судьба.

Исторических сведений о сословной принадлежности носителей фамилии Вилия почти нет. В дореволюционных метрических книгах она изредка встречается среди мещан и крестьян западных губерний, но не была массовой. В советское время фамилия могла появиться и у людей других национальностей — например, у литовцев или поляков, где окончание -я естественно для женских фамилий (ср. литовские фамилии на -я: Гедвила, Бируте). В русском контексте она остаётся редкой и запоминающейся.

Итог: если вы носите фамилию Вилия, скорее всего, ваши предки жили на берегах одноимённой реки в Беларуси или Литве. Это самая надёжная версия. Менее вероятно, но не исключено, что фамилия ведёт начало от личного имени или прозвища.