Фамилия Винеев образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основе, оканчивающейся на мягкий согласный или й. Вопрос в том, что лежит в основе: личное имя, прозвище или профессия. Самая прямая версия — отчество от нецерковного имени или прозвища Виней. В старых русских говорах «винея» — нерадивый, ленивый человек, тот, кто «виляет», уклоняется от дела. Корень здесь тот же, что и в глаголе «вилять»: изначально — крутить, изгибать, а в переносном смысле — хитрить, увёртываться. Таким образом, первый носитель фамилии мог быть сыном человека по прозвищу Виней, то есть ленивого или хитроватого.

Менее вероятна, но возможна связь с виноделием. «Винея» могло быть диалектным или профессиональным обозначением виноградаря или торговца вином, особенно в южнорусских регионах, где было развито виноградарство. Однако эта гипотеза слабее: слово «винея» в значении «ленивец» фиксируется в словарях народных говоров, а винодельческая терминология в русском языке в основном заимствована и редко становилась основой для прозвищ на -ей.

Третья, совсем редкая версия — от имени Виней как краткой формы от Виссарион или Вениамин. В русской народной традиции сложные канонические имена часто сокращали до простых и понятных: Вениамин мог превратиться в Веню, но Виней — это уже сильное искажение, маловероятное для реальной антропонимии.

Фамилия не относится к числу распространённых. Встречается в центральных областях России, эпизодически — в Поволжье. Дворянских родов с такой фамилией в официальных родословных книгах нет, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение. По сути, Винеев — это типичная «прозвищная» фамилия, закрепившаяся за потомками человека, которого в деревне дразнили за лень или хитрость.