Фамилия Винеева — женская форма фамилии Винеев, и её разбор стоит начать с окончания -ев, а не с корня. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Винеев — это сын Винея. А вот с основой «Виней» всё сложнее: в русской ономастике нет однозначного канонического имени или прозвища с таким звучанием. Это редкий случай, когда фамилия построена по продуктивной модели, но исходное слово почти исчезло из языка.

Вероятнее всего, прозвище Виней образовано от глагола «вить» или «виться». В диалектах «винея» могли называть извилистый ручей, вьющееся растение или человека с вьющейся шевелюрой. Такие прозвища по внешности или по местности давали часто: Витей, Вьюном, а Виней — та же смысловая линия, но с редким суффиксом -ей. Менее вероятна связь с именем Вениамин (через сокращение Веня), так как переход «н» в «и» в корне нехарактерен для русской народной этимологии.

География фамилии подсказывает ещё одну версию. Винеевы встречаются в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае и Кировской области. В этих местах были распространены финно-угорские названия, и корень «вин» мог прийти из коми или удмуртского языка, где «вин» означает «вода» или «река». Тогда Виней — это прозвище человека, жившего у воды, или выходца с реки Винеи. Такая гипотеза объясняет редкость фамилии: она возникла в замкнутой местной традиции, а не в общерусском именослове.

В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова фамилия Винеев не отдельно разбирается, но модель с суффиксом -ей и корнем «ви-» встречается в фамилиях Витеев, Вихрев, Вияев. Все они образованы от прозвищ, связанных с движением, гибкостью или природными объектами. Винеева, скорее всего, встаёт в этот же ряд — как память о предке, которого за что-то прозвали Винеем, будь то кудрявая голова, извилистая тропа у дома или название речки.

Сословная принадлежность у Винеевых не закреплена: фамилия встречается и у крестьян, и у мещан, что типично для прозвищных фамилий, не привязанных к дворянскому роду. Никаких громких исторических фигур с этой фамилией не зафиксировано, и это не делает её менее интересной — наоборот, она хранит след местного говора или диалектного слова, которое сегодня почти забыто.