Фамилия Воднев образована от прозвища Водень. Оно ведет свое начало от нарицательного «вода». В фольклоре хозяином земных вод выступал также змей, дракон, чудище и другие персонажи. Поэтому Водень может относиться так называемым «охранительным» именам. В данном случае, надеясь иметь красивого и здорового мальчика, родители назвали его Воднем. Возможно также, что прозвище Водень образовано от географического названия местности. Очевидно, предок обладателя данной фамилии жил неподалеку от водоема. Согласно еще одной гипотезе, в основе прозвища лежит нарицательное «вод», то есть «поводырь, военачальник, коновод, погонщик лошадей». Поэтому не исключено, что прозвище Водень относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Водень, со временем получил фамилию Воднев.