Фамилия Водопоенко — характерный пример украинской фамилии, образованной от прозвища по роду занятий. Основа здесь — «водопой» или «водопоенко», то есть человек, который поит скот. Водопоем называли место на реке или пруду, куда выгоняли лошадей, коров и овец на водопой. Прозвище Водопой мог получить пастух, конюх или работник, следивший за порядком на таком месте. Суффикс -енко типичен для восточной Украины (Полтавщина, Слобожанщина, Черниговщина) и означает «сын» или «потомок». Таким образом, Водопоенко — буквально «сын Водопоя» или «потомок того, кто занимался водопоем».

Интересная деталь: в отличие от более распространённых фамилий на -енко (Шевченко, Коваленко), Водопоенко сохраняет в основе не имя или профессию в чистом виде, а именно место действия. Это сближает её с «топографическими» фамилиями вроде Запорожченко или Луганенко, но с явным указанием на конкретное занятие. В русском языке фамилия могла бы звучать как Водопоев (с суффиксом -ов), но украинская модель -енко закрепилась в документах ещё в XVII–XVIII веках, когда казацкая старшина и крестьяне активно записывались в реестры.

Географически фамилия Водопоенко встречается преимущественно в центральных и восточных областях Украины, реже — на юге России (в Ростовской области и Краснодарском крае, куда переселялись украинцы). Встречаются и варианты написания: Водопоянко, Водопойко, но они редки. Сословного статуса у фамилии нет: её носили и казаки, и крестьяне, и мещане — прозвище было бытовым, не указывающим на знатность.

Сравните с однокоренными фамилиями: Водопьянов (русский вариант, с ударением на «я» — от «водопьяный», то есть любитель выпить, что ошибочно путают с водопоем), Водополов (от «водополь» — половодье) и Водянников (от «водяник» — водяной или работник на воде). Водопоенко стоит особняком: её корень недвусмысленно отсылает к скотоводству и сельскому быту, без мистических или негативных оттенков.