Фамилия Волкиндон — редкая и составная, её структура сразу бросается в глаза. В русской ономастике такие фамилии почти не встречаются, и это первый ключ к разгадке. Основа «Волк» прозрачна: от названия зверя, которое в дохристианской Руси могло быть личным именем-оберегом (чтобы ребёнок перенял силу и выносливость хищника) или прозвищем за характер — угрюмый, одинокий, свирепый. Вторая часть «индон» — явно нерусская. Скорее всего, это западноевропейское влияние, а именно — немецкое окончание «-dohn» или «-don», которое в фамилиях передавало принадлежность к местности (например, фамилия Волькендон в Германии). Возможно, предок был выходцем из немецких колонистов, которых в XVIII–XIX веках приглашали в Россию, и его фамилию русифицировали, приспособив к русскому произношению: «Волк» вместо «Вольф», а «индон» — как искажённое «-dohn».

Есть и другая версия, менее вероятная, но допустимая: «Волкиндон» могло возникнуть как прозвище в среде русских солдат или мастеровых, которые общались с иностранцами. Например, кого-то дразнили «волк индонезийский» или «волк индон» — по созвучию с далёкой страной. Но это лишь догадка, без письменных подтверждений.

Словообразовательно фамилия не вписывается в стандартные русские модели на -ов, -ин, -ский. Она стоит особняком, что указывает на её позднее появление и искусственное происхождение — скорее всего, как запись фамилии иностранца в русских документах. Географически такие фамилии единичны, и найти их можно в метрических книгах южных губерний (например, на Волыни или в Новороссии), где селились немецкие колонисты.

По сословию предки, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, а не дворянами: фамилии с «звериной» основой в среде помещиков встречались редко. Если же корень был именным (от древнерусского имени Волк), то носитель мог быть и из простых свободных людей, у которых прозвище перешло в фамилию.

Таким образом, Волкиндон — это гибрид: русская звериная основа, скрещённая с западной приставкой-окончанием. Фамилия-переселенец, которая могла измениться до неузнаваемости при записи в церковных книгах.