Фамилия Волкогон — из числа тех, что прямо указывают на занятие или особенность предка. Ее основа — прозвище Волкогон, которое в русских говорах имело вполне конкретный смысл: так называли гончую собаку, натасканную на волка, а не на зайца или лисицу. Прозвище, таким образом, было профессиональным. Первый носитель фамилии мог быть охотником, специализирующимся на волчьей охоте, либо псарем — человеком, который разводил и тренировал таких собак.

Слово «волкогон» составное: «волк» (зверь) и «гон» (от «гнать», «преследовать»). В отличие от более известной фамилии Волкодав, где корень указывает на то, что собака «давит» зверя, Волкогон подчеркивает именно преследование, гон. Это тонкое, но важное различие в охотничьей терминологии.

Модель образования фамилии простейшая и самая распространенная в русской ономастике: прозвище, заканчивающееся на твердый согласный, превратилось в фамилию с помощью суффикса -ов (Волкогон + ов). Вопрос о том, писался ли в старых документах конечный гласный (Волкогонов), остается открытым — в обиходе фамилия закрепилась в более краткой форме Волкогон, что для прозвищных фамилий не редкость.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским регионам, где охота на волка была промыслом, а слово «волкогон» бытовало в живой речи. Встречаются также варианты с украинским суффиксом -енко (Волкогоненко), что подтверждает ее восточнославянские корни.

Никакой другой, более сложной этимологии у фамилии нет: попытки связать ее с «гоном» в значении «изгнание» или с мифическим существом лишены лингвистических оснований. Фамилия — прямой и ясный след охотничьего быта, где прозвище по собаке легко переходило на ее хозяина.