Фамилия Волкогонов — одна из тех, что прямо указывает на занятие или особенность предка. В её основе лежит прозвище Волкогон, а оно, в свою очередь, восходит к нарицательному «волкогон». Так в псовой охоте называли гончую собаку, которая предпочитает работать по волку, а не по зайцу или лисице. Это узкий профессиональный термин, а не просто образное выражение.

Стало быть, прозвище Волкогон мог получить не всякий охотник, а человек, который либо разводил и тренировал таких собак (псарь), либо сам был заядлым волчатником. Владельцы псарей и ловчие, специализировавшиеся на волке, ценились в помещичьих хозяйствах — охота на волка была делом опасным и требовала особой выучки как от собак, так и от людей.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Волкогон добавили патронимический суффикс -ов. Получается «Волкогонов» — сын Волкогона, потомок человека с таким прозвищем. Суффикс -ов, а не -ин, указывает на то, что основа прозвища оканчивалась на твёрдый согласный.

В отличие от многих «животных» фамилий (Волков, Зайцев), здесь нет прямой связи с самим зверем. Волкогонов — не «волчий сын», а потомок человека, имевшего отношение к собакам, которые травят волка. Эта деталь заметно сужает круг возможных занятий предка и делает фамилию более конкретной, ремесленной.

Встречаемость фамилии невысокая, что тоже косвенно подтверждает её узкопрофессиональное происхождение. Маловероятно, что прозвище давали просто так, «за характер» — слишком конкретно значение. Скорее всего, первый Волкогон действительно был псарём или охотником, приставленным к волчьей охоте.