Фамилия Ворожейкина — женская форма фамилии Ворожейкин. В основе лежит прозвище Ворожейка, которое в старину давали людям, занимавшимся ворожбой, гаданием или знахарством. В русских говорах «ворожейка» — это женщина, которая ворожит, колдует, лечит заговорами. Мужская форма, Ворожейкин, указывает на потомка такого человека: сына или внука ворожейки. Суффикс -ин в фамилии типичен для русского Севера и центральных областей: он отвечает на вопрос «чей?» и прикрепляется к основам на -а, -я. В данном случае к основе Ворожейк-.

Интересно, что фамилия Ворожейкина (и Ворожейкин) встречается в основном в Поволжье и на Урале — в регионах, где долго сохранялись языческие пережитки и народная магия. По данным переписей XIX века, носители фамилии чаще всего были крестьянами и мещанами. Само прозвище Ворожейка не обязательно несло отрицательный оттенок: на Руси к ворожеям и знахарям относились двойственно — их и боялись, и уважали за умение лечить и предсказывать. Таким образом, предок современных Ворожейкиных мог быть деревенским целителем или гадалкой, чьё ремесло закрепилось в родовом имени.