Фамилия Вотькина — женская форма фамилии Вотькин, и её разбор стоит начать с неочевидного на первый взгляд корня. Основа «Вотьк-» восходит не к глаголу «вотькать» (такого слова в литературном языке нет), а к уменьшительной форме имени или прозвища. Скорее всего, перед нами производное от канонического имени Вот — краткой формы от Вотислав, Вотех или, что вероятнее, от крестильного имени Фотий. В русских говорах звук «ф» часто заменялся на «в» или «хв», так Фотий превращался в Хвотей, а при дальнейшем упрощении — в Вот. Суффикс «-к-» указывает на уменьшительно-ласкательную форму: Вот → Вотька. Дальше по стандартной модели: Вотька + -ин = «сын Вотьки» или «внук Вотьки», то есть принадлежащий человеку по прозвищу Вотька.

Суффикс «-ин» в фамилии Вотькина — один из древнейших в русской ономастике, он образовывал притяжательные прилагательные от имён и прозвищ на -а/-я. Такие фамилии чаще всего встречались на севере и в центральной России, в среде крестьян и посадских людей. Если бы основа оканчивалась на согласный, появился бы суффикс «-ов», но здесь именно «-ин» — верный признак того, что прозвище предка звучало как Вотька.

Менее распространённая, но допустимая версия связывает фамилию с топонимом. В Вятской губернии и в Пермском крае есть деревни с названием Вотькино или Вотькина. Переселенцы из этих мест могли получить фамилию по названию родного села. В этом случае Вотькина — не отчество, а указание на географическое происхождение: «из Вотькина». Такая модель встречается реже, но для фамилий с окончанием на «-ин» от названий деревень она типична.

С точки зрения социальной истории, фамилия Вотькина не принадлежала к дворянским. Её носители — скорее всего, крестьяне или ремесленники. В документах XVII–XVIII веков можно встретить упоминания крестьян Вотькиных в вологодских и архангельских писцовых книгах, что подтверждает северное происхождение. В отличие от фамилий на «-ский», которые часто указывали на шляхетское или духовное сословие, Вотькина оставалась фамилией простого люда.

Интересная деталь: ударение в фамилии может падать как на первый слог (Во́тькина), так и на второй (Вотькина́). Первый вариант характерен для северных говоров, где ставили ударение на корень, второй — для южных и центральных областей. В современном употреблении чаще встречается ударение на первый слог, но в метрических книгах XIX века можно найти оба варианта.