Фамилия Войнич — одна из тех, где славянская основа «войн» (воин, солдат) очевидна, но механизм её превращения в фамилию сложнее, чем кажется на первый взгляд. Если исходить из самого прямого пути, прозвище Воин давали мужчине за военную службу, бойцовский характер или участие в походах. Однако в случае с фамилией Войнич мы имеем дело не с русской моделью на -ов/-ев, а с западнославянским или украинским суффиксом -ич. В польском, белорусском и украинском языках -ич (или -icz) — это патронимический суффикс, указывающий на происхождение: «сын Воина». То есть Войнич буквально значит «сын Воина» или «потомок Воина».

Географически фамилия Войнич чаще всего встречается в Польше, на западе Украины и в Беларуси. В России она редка и обычно связана с переселенцами из этих регионов. В польской ономастике существует целое гнездо однокоренных фамилий: Война, Войник, Войницкий, Войнович. Из них Войнич — одна из самых компактных по форме, но при этом однозначно указывающая на отчество.

Есть и вторая версия, менее популярная, но имеющая право на существование: фамилия могла произойти не от прозвища, а от названия населённого пункта Войнич (например, село в Польше или деревня в Словакии). В этом случае человек получал фамилию по месту жительства: «приехал из Войнича». Однако сторонники этой гипотезы упираются в то, что топоним Войнич сам, скорее всего, образован от того же личного имени Воин, так что в конечном счёте обе версии сходятся к воинской основе.

Словообразовательный разбор показывает, что ударение в фамилии падает на первый слог — Войнич (а не Войнич), что типично для польских патронимов. В дореволюционных документах встречается вариант написания Войничь, с мягким знаком на конце, что отражало мягкое произношение [ч'] в украинской и белорусской традиции.

В социальном плане фамилия Войнич не была дворянской. Её носители, как правило, относились к крестьянскому или казачьему сословию. Зато она приобрела широкую известность благодаря писательнице Этель Лилиан Войнич, автору романа «Овод». Хотя она была англичанкой, её фамилия — польского происхождения (по мужу), и именно этот литературный факт закрепил фамилию в русском культурном поле.