Фамилия Врачко — редкий пример, где прозрачная основа обманчива. Кажется, что перед нами потомок врача, но в славянской ономастике всё сложнее. Если бы фамилия значила «сын врача», она скорее звучала бы как Врачев или Врачов. Суффикс -ко типичен для украинской, белорусской и южнорусской модели, где он образует прозвища или уменьшительные имена: Врачко — это не «сын врача», а «маленький врач» или, что вероятнее, человек, который кого-то напоминает или подражает. Основа могла закрепиться за знахарем, костоправом или просто человеком, который любил давать советы по здоровью, — в деревнях таких называли «врачом» в ироничном или уважительном смысле.

Но есть и другая версия, которую поддерживают специалисты по исторической антропонимике. В древнерусских говорах слово «врач» означало не только лекаря, но и колдуна, ворожея. В языческой традиции врачевание было неотделимо от заговоров и магии, поэтому «врач» и «волхв» иногда пересекались. Фамилия Врачко могла достаться потомкам деревенского знахаря или человека, которого считали ведуном. Отсюда и прозвищный суффикс -ко — он часто указывал на молодого или подчинённого: Врачко — «помощник врача» или «тот, кто слывёт врачом».

В польском языке есть слово «wrożka» (гадалка) и «wróżyć» (ворожить), что фонетически близко к «врач». Не исключено, что в западных регионах бывшей Речи Посполитой фамилия Врачко могла возникнуть от глагола «врать» в значении «говорить неправду, заговаривать». Тогда прозвище Врачко давали болтуну или тому, кто умел красиво обманывать. Но это маргинальная гипотеза: для неё нет массовых подтверждений в переписях.

Географически фамилия тяготеет к западноукраинским землям (Галиция, Волынь) и югу Беларуси. В дореволюционных метрических книгах Врачко встречается в Подольской и Волынской губерниях, реже — на Кубани, куда фамилию занесли переселенцы. В русских центральных губерниях она почти не фиксируется, что подтверждает её западнорусское происхождение.

Словообразовательно фамилия стоит в ряду с Врач, Врачев, Врачук. Врачко — самая редкая форма, сохранившая старый уменьшительный суффикс. По сословной принадлежности носители были в основном крестьянами и казаками, среди дворянства фамилия не отмечена. Со временем, когда профессия врача стала престижной, часть Врачко могла сознательно сменить фамилию на более «медицинскую» — например, на Врачев, — но такие случаи единичны.