Фамилия Вычужанины — редкий случай, когда прозвище предка можно восстановить почти дословно, опираясь на живые диалектные глаголы. В основе фамилии лежит прозвище Вычужень, а оно образовано от глагола «вычужать». В сибирских и саратовских говорах это слово означало «придумывать что-то затейливое», «чудить», «выдумывать». Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, был склонен к фантазиям, любил удивлять окружающих необычными идеями или поступками.

Фамилия построена по продуктивной модели с суффиксом -ин, который в русском языке указывает на принадлежность: «чей?» — Вычужанин, то есть сын, потомок Вычужня. Интересно, что в самой фамилии сохранился не исходный корень «вычуж-», а основа с наращением «-ан-», что типично для ряда северных и уральских говоров. Такое оформление встречается у фамилий, образованных от прозвищ на -ень: Вычужень → Вычужанин, как, например, Скорбень → Скорбянин.

О точном месте возникновения фамилии говорить сложно — процесс формирования фамилий у крестьян и посадских людей шёл вплоть до XIX века. Однако диалектная привязка «вычужать» к Сибири и Саратовскому Поволжью даёт ориентир: предки Вычужаниных могли жить именно в этих регионах или выходцами оттуда. Фамилия не получила широкого распространения, что делает её ценным памятником местной славянской лексики и народной культуры.