Фамилия Вырупаев является фонетическим вариантом фамилии Вырыпаев, которое восходит к прозвищу Вырыпай. Вырыпаем могли назвать родители шаловливого сына. По другой версии, двнное прозвище восходит к слову «воропай». В белорусском языке оно означает «слепой». В этом случае прозвище Вырыпай указывало на особенности внешности предка. Так и прозвище Вырыпай закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Вырупаев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Вырыпай, со временем получил фамилию Вырупаев.