Фамилия Вышенковы — одна из тех, где за привычным окончанием скрывается неочевидная история. Если отбросить суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Вышенка), то корнем оказывается не имя, а прозвище Вышенок. В старой русской ономастике суффикс -ок часто придавал слову уменьшительный или, наоборот, ироничный оттенок.

Самое прямое объяснение — от слова «вышина». В таком случае прозвище Вышенок мог получить либо очень высокий человек, либо тот, кто занимал видное место в обществе или на службе. Но есть и другой ход: на Руси нередко давали прозвища «от противного» — маленького роста человека могли в насмешку назвать Вышенком. Обе версии имеют право на жизнь, и без точных записей о первом носителе выбрать одну из них сложно.

Третья, менее очевидная возможность — топонимическая. Человек мог получить прозвище по месту жительства: на возвышенности, на «вышке», на высоком берегу реки. В говорах слово «вышенка» иногда означало небольшую вышку или пристройку, что тоже могло стать основой. К сожалению, точное место и время возникновения фамилии Вышенковы установить пока не удаётся: процесс становления фамилий в разных регионах шёл с XVII по XIX век неравномерно, и письменных источников по этой фамилии сохранилось немного.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для центральной России: прозвище на -ок плюс стандартный патронимический суффикс -ов. Фамилия Вышенковы — не из самых частых, но и не единичная; её можно встретить в разных областях, что говорит скорее о независимом возникновении в нескольких местах, чем о едином родовом гнезде.