Фамилия Выскочева — это женская форма фамилии Выскочев, и её происхождение напрямую связано с прозвищем Выскочка. Вопреки расхожему мнению, прозвище это в старину не всегда носило негативный оттенок. «Выскочкой» могли назвать человека расторопного, бойкого, того, кто быстро продвигался по службе или в хозяйстве, «выскакивал» вперёд других. В некоторых говорах слово имело и более конкретное значение — «внезапно разбогатевший», «выбившийся в люди из низов».

Модель образования типична для северных и центральных областей России: основа прозвища (Выскоч-) плюс суффикс -ев, который присоединяли к основам на мягкий согласный или шипящий. Таким образом, Выскочев — буквально «сын Выскочки», а Выскочева — его жена, вдова или дочь. Интересно, что в некоторых документах XVII века встречается написание Выскочов, что отражает местное «оканье» и произношение твёрдого [ч].

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Выско́чев/Выско́чева, хотя в бытовой речи возможны варианты. Это недворянская фамилия: она не фиксируется в родословных книгах, но встречается в переписных книгах Вятки, Пермской губернии и Поволжья — регионах, где крестьяне и посадские люди часто получали фамилии от прозвищ с яркой характеристикой.

Стоит учитывать, что в редких случаях фамилия могла образоваться от топонима — например, от названия деревни Выскочка (такие есть в Смоленской и Тверской областях). Но основная версия — прозвищная: предок носителя фамилии был человеком заметным, пробивным, возможно, не без доли авантюризма.