Фамилия Высоченко — один из характерных примеров украинской модели образования фамилий с суффиксом -енко. Этот суффикс, изначально означавший «сын» или «потомок» (малый, молодой), в XVII–XVIII веках стал универсальным маркером фамилий на Левобережной и Слободской Украине. Со временем он утратил чисто патронимическое значение и закрепился как фамильный формант, поэтому «Высоченко» — это буквально «сын Высокого» или, шире, «потомок того, кого звали Высокий».

Прозвище Высокий, от которого образована фамилия, могло быть дано рослому, статному человеку. Однако есть и более правдоподобная версия: в основе фамилии лежит название села или хутора Высокое. Таких топонимов на Украине десятки — от Высокого под Киевом до одноимённых сёл на Полтавщине, Черниговщине и Сумщине. Переселенцы, получив фамилию по месту выхода, становились «Высоченками», то есть выходцами из Высокого. Эта модель — одна из самых распространённых в украинской ономастике, и для фамилии Высоченко она выглядит убедительнее, чем прямая связь с ростом человека.

Не исключено также, что прозвище указывало не на конкретный населённый пункт, а на особенность ландшафта. Украинское слово «височина» означает возвышенность — ровную или слегка всхолмлённую часть равнины, расчленённую балками и оврагами. Человек, живший на такой возвышенности, мог получить прозвище Высокий, а его дети — фамилию Высоченко. В этом случае фамилия несёт не антропологическую или топонимическую, а географическую информацию: она прямо указывает на рельеф места, где обосновался род.

Интересно, что фамилия Высоченко встречается в основном в центральных и восточных областях Украины, особенно в Черкасской, Полтавской и Днепропетровской. Это согласуется с ареалом распространения типично украинских фамилий на -енко и одновременно с зоной, где топонимы «Высокое» встречаются наиболее часто. В России фамилия редка и обычно фиксируется в тех регионах, куда в XVIII–XIX веках переселялись украинские крестьяне и казаки — на Кубань, Дон и в южные губернии.

Таким образом, Высоченко — фамилия с прозрачной этимологией, но не с одним, а с двумя возможными источниками: либо от прозвища по росту, либо от названия села или урочища. Обе версии правдоподобны, и в каждом конкретном роду истинная причина могла быть своей. Фамилия не указывает на сословие — её могли носить и казаки, и крестьяне, и мещане. В документах XVIII века встречаются варианты написания «Высоченко» и «Височенко», что отражает диалектное произношение (икавизм, характерный для части украинских говоров).