Фамилия Вьюнышев — пример, который сразу ставит перед исследователем вопрос: откуда взялся суффикс «-ыш-»? В русских фамилиях он встречается нечасто. Обычно фамилии образуются через стандартные «-ов», «-ев» или «-ин». Здесь же мы видим цепочку: основа «вьюн-», затем «-ыш-» и фамильный суффикс «-ев». Модель напоминает образование от прозвища или имени с уменьшительно-ласкательным оттенком: Вьюныш — так могли называть человека.

Самая прямая и правдоподобная версия — происхождение от слова «вьюн». У этого слова два основных значения, и оба могли стать источником прозвища. Первое — рыба (вьюн обыкновенный), юркая и скользкая, которая живёт в тине и быстро уходит из рук. Второе — сам вьюнок, растение, которое вьётся, или вообще любой предмет, который вьётся (например, вьюшка в печи). Прозвище Вьюн давали человеку подвижному, увертливому, изворотливому — либо по характеру, либо по манере поведения. От этого прозвища и пошёл уменьшительный вариант Вьюныш («маленький Вьюн» или «сын Вьюна»), а от него — фамилия Вьюнышев.

Суффикс «-ыш» в русском языке часто придаёт слову оттенок уменьшительности или ласкательности (ср. «глупыш», «малыш», «крепыш»). Соответственно, Вьюныш — это либо младший родственник Вьюна (сын), либо человек, которого так называли в детстве или в шутку. Со временем это прозвище закрепилось за семьёй, и потомки стали Вьюнышевыми. Фамилия недвусмысленно указывает на то, что предок носителя не был дворянином или духовным лицом — скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвища были обычным делом.

Географически фамилия редкая. Встречается преимущественно в центральных и северных областях России, но без выраженного гнезда. В дореволюционных переписях и метрических книгах она фиксируется эпизодически, что говорит о её локальном, а не массовом характере. В отличие от фамилий Вьюнов или Вьюнков, которые встречаются чаще и понятнее по форме, Вьюнышев — более сложный случай, который требует разбора словообразовательной цепочки. Это как раз тот случай, когда фамилия хранит в себе не только прозвище, но и его внутреннюю форму — уменьшительное имя, данное когда-то одному человеку.