Фамилия Яблонина — женская форма, а её мужской вариант — Яблонин. Эта фамилия образована от прозвища или нецерковного имени Яблоня. В русской традиции такие «растительные» прозвища давали по внешним признакам, характеру или месту жительства. Яблоней могли назвать человека с румяными щеками, садовода, разводившего яблони, или того, кто жил у яблоневого сада. Суффикс -ин указывает на принадлежность: буквально «чей?» — Яблонин, то есть сын или потомок Яблони. Это типичная для северных и центральных областей России модель образования фамилий, в отличие от южных, где чаще использовали суффикс -ов.

Интересно, что в основе лежит не нарицательное «яблоко», а именно «яблоня» — дерево. Это редкий случай, когда фамилия образована от названия растения целиком, а не от его плода. Сравните с более частыми фамилиями Яблоков, Яблочкин — они произошли от прозвища Яблоко, которое могли дать круглолицему или румяному человеку. Яблонин же отсылает к дереву, что могло указывать на связь человека с конкретным местом: например, в писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются крестьяне, записанные по деревне, носившей название Яблонное или Яблонь. В таком случае фамилия могла возникнуть из топонима, а не из прозвища.

В ономастических словарях, например у Бориса Унбегауна, фамилии на -ин от названий деревьев и растений описываются как характерные для крестьянской среды. Яблонины в основном встречались в центральных губерниях России — Владимирской, Костромской, Нижегородской. Сословно это были крестьяне или мещане, без привязки к знатным родам. Дворянских гербов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её народное происхождение. Сегодня фамилия редкая, но не исчезнувшая: по данным переписей, несколько десятков семей Яблониных живут в Поволжье и на Урале.