Фамилия Яфаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Яфаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Яфаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Яфаев образована от диалектного варианта мужского тюркского имени Япанча — Яфай. Имя Япанча в переводе на русский язык означает «степняк, житель степи». Это имя давалось мальчикам, родившимся в степи. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Яфаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Яфаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.