Фамилия Ягницин — из числа тех, что сразу цепляют внимание непривычным звучанием. Корень здесь не «ягода» и не «ягнёнок», хотя первое впечатление может быть обманчивым. Основа фамилии — слово «ягница», которое в старых русских говорах, особенно на севере и в центральных областях, имело два значения. Первое и самое прямое — овца, чаще молодая, ярка. Второе, переносное — так могли назвать кроткого, безобидного или слишком тихого человека, возможно, даже плаксивого. Прозвище Ягница давали по характеру или по внешности, и оно вполне могло закрепиться за родоначальником.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей сын?» — Ягницин, то есть сын Ягницы. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Ягни́цин. Это характерно для фамилий, образованных от слов с суффиксом -иц(а): Курицын, Синицын, Лисицын. Интересно, что в некоторых говорах слово «ягница» могло звучать как «ягни́ца» с ударением на второй слог, что и определило форму фамилии.

Географически фамилия редкая, её очаги, по данным современных списков, тяготеют к Вологодской, Архангельской и Кировской областям — тем самым регионам, где северорусское «яканье» и диалектная лексика сохранялись дольше всего. Встречаются единичные носители и в Сибири, куда фамилия могла попасть с переселенцами из Поморья.

С точки зрения социального контекста, Ягницины — это, скорее всего, потомки крестьян или посадских людей. Фамилия недворянская, не книжная, а бытовая, прозвищная. Она не попала в родословные книги, но от этого не менее интересна: за ней стоит живая речь русского Севера, где овцу называли не «овца», а «ягница», а человека могли прозвать по сходству с этим животным без всякой обиды — по-соседски, метко.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: от имени Ягнис, которое могло быть народной формой какого-нибудь канонического имени (например, Агний, от греческого «агнос» — чистый). Но в русской ономастике такие случаи единичны, и связь с диалектным словом «ягница» выглядит гораздо убедительнее.