Фамилия Ягудаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Ягудаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Ягудаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Ягудаев образована от мужского тюркского имен Ягудай. Первая из них ведет свое начало от имени Ягуда, которое в переводе на русский язык означает «иудей, еврей», «прославляющий Бога». Вторая часть происходит от тюркского «ай». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Ягудаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Ягудаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.