Фамилия Якимечко — один из характерных примеров украинской модели фамилий на -енко, но с необычной огласовкой. Стандартная украинская форма от имени Яким — Якименко. Вариант Якимечко встречается реже, и его происхождение стоит искать не в механической замене суффикса, а в диалектных или фонетических особенностях.

Основа фамилии — крестильное имя Иоаким. В народной русской и украинской традиции оно превратилось в Яким. Имя древнееврейское, означает «Бог восставит» или «поставленный Богом». На Руси оно было распространено, но в XIX веке стало восприниматься как простонародное, крестьянское. Именно поэтому фамилии от Якима так часты в среде бывших государственных и помещичьих крестьян юга России и Украины.

Суффикс -ечко в украинской антропонимии — вариант суффикса -енко, но с другим редуцированным гласным. Обычно -енко означает «сын» или «потомок» (Якименко — «сын Якима»). Форма Якимечко могла возникнуть в говорах, где после мягкого согласного [м'] звук [е] переходил в [и] или где действовали особые правила чередования. Вторая версия: это не патроним, а уменьшительная форма от имени Яким с суффиксом -ечко (сравните: Ванечка, Митечка). В таком случае Якимечко — это «маленький Яким», то есть прозвище младшего в роду или ребёнка. Со временем прозвище закрепилось как фамилия.

Географически фамилия тяготеет к западным и центральным областям Украины — Волынь, Подолье, Киевщина. В России она редка, встречается в основном среди потомков украинских переселенцев на Кубани и в Сибири. В польских метриках XVIII — начала XIX века можно найти запись Jakimeczko — это указывает на то, что фамилия бытовала на землях, входивших в Речь Посполитую, где украинская антропонимия испытывала влияние польской орфографии.

Сословно носители фамилии почти всегда были крестьянами или казаками. Дворянских родов Якимечко не зафиксировано. В ревизских сказках XIX века Якимечки записаны как «малороссияне» — то есть государственные крестьяне, не знавшие крепостного права. Это объясняет, почему фамилия сохранила свою народную, неадаптированную форму — её не «исправляли» канцеляристы на великорусский лад.