Имя Якимка, которое легло в основу фамилии Якимкин, представляет собой обиходный вариант мужского имени Иоаким, которое в переводе с древнееврейского означает «поставленный богом». Не следует также исключать возможность образования фамилии Якимкин от прозвища Якимка: иногда это имя употреблялось как нарицательное в значении «простак». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якимка, со временем получил фамилию Якимкин.