Фамилия Якобше — редкий пример того, как немецкая основа получила русское оформление, но не по самой частотной модели. В основе лежит имя Якоб (немецкая форма библейского Иаков), а суффикс «-ше» указывает на польское или белорусское посредничество. В польском языке фамилии на «-ше» (как Якубше, Павлюкше) образуются от имени отца с помощью суффикса «-sz-» (читается как «ш»), который затем наращивается окончанием «-е». Это типичная западнославянская патронимическая модель: Якобше — буквально «сын Якоба».

В русском языковом пространстве такая фамилия почти не встречается, её ареал — западные губернии бывшей Российской империи, особенно территория современной Беларуси и Польши. Если предки носителя фамилии жили в XIX веке, они с высокой вероятностью были крестьянами или мещанами, попавшими в ревизские сказки под записью «Якобше». Имя Якоб у лютеран и католиков было распространено шире, чем у православных, поэтому фамилия могла принадлежать потомкам немецких колонистов, осевших в Царстве Польском или на Волыни, или же полякам, чьи предки приняли немецкое имя через брак или соседство.

В отличие от фамилий на «-ов» или «-ин», Якобше не склоняется по падежам как типичная русская фамилия: это наследие польской грамматики, где окончание «-е» застыло. В современной России фамилия остаётся экзотической — её носители, скорее всего, потомки тех, кто мигрировал с запада в советское время или в ходе переселений. Единственная надёжная привязка — к региону Гродненской или Брестской области, где такие формы фиксировались в метрических книгах конца XIX века.