Фамилия Якшимбетова образована от мужского имени Якшимбет, которое восходит к тюркскому слову «якшембе», что значит «воскресенье, воскресный». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Якшимбетовых можно лишь на основании генеалогических исследований.