Фамилия Якшиева — женская форма русской фамилии Якшиев. В основе лежит тюркское мужское имя Якший. В переводе с татарского, башкирского и ряда других тюркских языков «якшы» (яҡшы) означает «хороший», «добрый», «отличный». Таким образом, имя Якший — это пожелательное имя, которое давали ребёнку с надеждой на его счастливую и благополучную судьбу. Подобные имена-пожелания были широко распространены у тюркских народов, и они легко становились основой для фамилий при переходе к русской антропонимической модели.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для Поволжья и Приуралья. К тюркской основе Якший добавили русский патронимический суффикс -ев (вместо более привычного -ов, что часто встречается после мягких согласных и шипящих). Фамилия Якшиев буквально означала «сын Якшия». Форма Якшиева — это указание на женщину, принадлежащую к роду Якшиевых (дочь или жена). В старых документах, особенно в метрических книгах, могло встречаться написание через «и» — Якшиев, но единая норма закрепила современный вариант.

Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием татар, башкир и других тюркоязычных народов: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская, Самарская области. Встречается она и у крещёных татар (кряшенов), которые при переходе в православие часто сохраняли родовые имена в качестве фамилий. Социальный состав носителей был разнообразным: от государственных крестьян до купцов и духовенства, но подавляющее большинство составляли крестьяне и мещане.

С точки зрения ономастики, фамилия Якшиева стоит в одном ряду с такими распространёнными тюркскими фамилиями на «хорошие» качества, как Акчурин (от «ак» — белый, чистый) или Байрамов (от «байрам» — праздник). Однако в отличие от них, Якшиев прямо указывает не на внешний признак, а на личную характеристику человека — его доброту, что делает её одной из немногочисленных «положительных» фамилий в русском ономастиконе тюркского происхождения.