Фамилия Якубенок относится к распространенному типу украино-белорусских фамилий и образована от крестильного имени Иаков. Мужское крестильное имя Иаков в переводе с древнееврейского означает «второй по рождению». Поэтому Якубенок буквально понималось как «сын Якуба».