Имя Якуб представляет собой польскую форму крестильного мужского имени Яков, которая распространилась также на Украине и в Белоруссии. Имя Яков (Иаков) переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Суффиксы -ян и -ец указывают на то, что фамилия Якубянец возникла под молдавским и украинским влиянием.