Фамилия Якусев — яркий пример того, как личное имя предка превратилось в родовое прозвание, но с неожиданным суффиксом. В основе лежит имя Якус, которое само по себе является производной формой от канонического имени Иаков (в русском обиходе — Яков). Уменьшительно-ласкательные варианты вроде Якуш, Якуня, Якута были распространены в крестьянской и мещанской среде, а Якус — одна из таких «усечённых» форм, характерная для северных и центральных говоров.

Обычно фамилии от имени Яков образуются с суффиксом -ов: Яковлев, Якушов, Якунин. Но здесь мы видим редкий суффикс -ев, который присоединился к основе на согласный (Якус-). Это указывает на то, что фамилия закрепилась в местности, где действовали особые фонетические законы: после твёрдого [с] ожидался бы суффикс -ов (Якусов), но написание через «е» говорит либо о влиянии акающих говоров (где «о» в безударном положении произносилось как «а» и на письме закреплялось как «е»), либо о том, что предок носителя фамилии был записан в документах с ошибкой писаря, который на слух передал «Якусев» вместо «Якусов».

Географически фамилия Якусев встречается преимущественно в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае, Кировской области и Татарстане. Это намекает на то, что предки могли быть государственными или помещичьими крестьянами, переселенцами из центральной России в XVI–XVII веках. В пользу редкого суффикса говорит и то, что в тех же регионах фиксируются однокоренные фамилии Якушев, Якунин, Якупов — все от того же имени Яков, но с разными моделями образования. Якусев — наименее частая из них, что делает её своеобразным маркером локального произношения или конкретной семьи.

Других версий, например, от тюркского корня или от прозвища, здесь нет: имя Яков было широко распространено среди русских, а суффикс -ев типичен для русского патронимического словообразования. Так что носитель фамилии Якусев может быть уверен: его предок по мужской линии носил имя Якус, а сама фамилия — живое свидетельство того, как в русской деревне люди называли друг друга коротко и по-свойски.