Фамилия Ямбушев — редкий случай, когда основа почти наверняка не русская, а тюркская или финно-угорская, а русский суффикс -ев лишь оформил её по модели отчества. Чтобы понять корень, нужно смотреть на географию и язык народов Поволжья и Урала.

Самая вероятная версия: фамилия образована от мужского имени Ямбыш (или Ямбай), распространённого у марийцев, удмуртов, татар и башкир. В основе этих имён лежит древнее тюркское слово «ям» — «дорога», «почтовая станция», либо марийское «ямбыш» — «проводник», «ведущий». Таким образом, именование Ямбыш могло означать «дорожный», «путник» или «тот, кто указывает путь». Суффикс -ев стандартно превратил имя в фамилию: Ямбышев, а со временем «ы» перешёл в «у» под влиянием акающих говоров или просто при записи — получился Ямбушев.

Менее убедительная, но встречающаяся гипотеза выводит фамилию от тюркского «ямбу» (или «ямбуз») — «подарок», «награда». Тогда Ямбушев означал бы «сын награждённого». Однако эта версия слабее, потому что имя Ямбыш реально зафиксировано в дореволюционных метрических книгах, а слово «ямбу» в значении «подарок» в живых языках почти не встречается.

Фамилия почти не встречается в центральной России. Её основной ареал — Марий Эл, Удмуртия, Татарстан, а также Башкортостан. Носители Ямбушевы — потомки крещёных марийцев или удмуртов, которые в XVIII–XIX веках получали фамилии по имени отца при записи в ревизские сказки. По сословной принадлежности это были в основном государственные крестьяне, реже — ясачные (платившие подать пушниной).

Если сравнивать с однокоренными, то в тех же регионах встречаются фамилии Ямбаев, Ямбашев, Ямбиков — все они образованы от одного корня, но с разными суффиксами. Ямбушев выделяется тем, что его основа, скорее всего, прошла через русскую адаптацию с заменой «ы» на «у», что делает её написание неочевидным для этимолога-любителя.