Этимология фамилии Яннаев, принадлежащей к распространенному типу русских фамилий, восходит к личному прозвищу. Фамилия Яннаев, по одной из гипотез, образована от имени Ян, западнославянской и прибалтийской формы от мужского имени Иоанн (Иван), которое в переводе с древнееврейского означает «Бог помиловал». Существует еще одна, более правдоподобная версия, согласно которой эта фамилия восходит к прозвищу Янн, в основе которого лежит междометие «Ян-Н», распространенное в иркутских и сибирских говорах и выражающее восклицанье сожаленья или упрека. В результате, потомки человека, обладающего прозвищем Янн, со временем получили фамилию Яннаев. Поэтому точно сказать, когда и где впервые появилась фамилия Яннаев, сложно.