Фамилия Янцытов — редкая и территориально привязанная, скорее всего, к Уралу или Сибири. Её основа — мужское имя Ян, которое в русской среде могло быть как формой славянского Иван (через польское Jan), так и тюркским или финно-угорским именем (например, у коми или марийцев). Суффикс -ытов указывает на патронимическую модель, но нестандартную: обычно от имён на -а, -я образуют фамилии на -ин (Янин), а здесь мы видим -ытов, что встречается реже и часто связано с диалектным произношением или адаптацией иноязычной основы. По сути, Янцытов — это «сын Янца», где Янец — уменьшительная форма от Ян.

Вероятнее всего, фамилия возникла в среде крестьян или служилых людей, осваивавших восточные земли России. В пользу этого говорит и окончание -ов, типичное для русских фамилий, но прикреплённое к нерусскому корню. Можно предположить, что родоначальник носила прозвище или имя Янц, а его потомки стали Янцытовыми. Интересно, что похожая модель встречается у фамилий типа Кунцов, Панцытов — все они редки и указывают на локальную ономастическую традицию, где суффикс -ец давал основу для образования отчества.

Однокоренные фамилии — Янцев, Янов, Янин — распространены шире, но Янцытов стоит особняком. Если искать социальный контекст, то носители этой фамилии в XIX веке могли быть государственными крестьянами или казаками (на Урале и в Сибири такие фамилии нередки). Точных данных о сословной принадлежности по Янцытовым в открытых источниках нет, но сама редкость формы говорит о том, что фамилия не прошла через унификацию в крупных городах и осталась в своём первоначальном, «местном» виде.