Фамилия Янтыкова — женская форма фамилии Янтыков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель «-ов» (в мужском варианте) указывает на типичную русскую патронимическую или прозвищную фамилию, образованную от личного имени или прозвища. В данном случае основа — «Янтык», а не «Янтык-ов» с двойным суффиксом, как может показаться на первый взгляд. Суффикс «-ык» в тюркских языках часто образует уменьшительные или ласкательные формы имён, либо указывает на принадлежность к чему-то. Таким образом, «Янтык» — это, скорее всего, производное от тюркского имени Янты (или Янтай) с добавлением «-ык», что даёт значение «маленький Янты» или «сын Янты».

Корень «Янт-» восходит к тюркским языкам, где «ян» (или «йан») означает «душа», «сторона» или «бок». В именах, например, у татар или башкир, «Ян» часто выступает как часть сложного имени (Янгир, Янбай), означая «душа» или «родной». Однако здесь корень может быть и от тюркского «янтык» — «кривой», «косой», что даёт прозвище по внешности или характеру: Кривой. В ономастике такие прозвища нередки: человека могли прозвать Янтыком за хромоту, асимметрию черт или просто за привычку ходить боком.

Географически фамилия Янтыкова встречается преимущественно в Поволжье и Приуралье, особенно среди башкир и татар. Это не случайно: в Башкортостане есть деревня Янтык (в Кугарчинском районе), название которой, вероятно, того же корня. Предки носителей фамилии могли быть выходцами из этой местности, где прозвище Янтык закрепилось за родом или отдельным человеком. В русском контексте фамилия могла появиться при переходе тюркского прозвища в русскую патронимическую форму: сын Янтыка стал Янтыковым, а его дочь или жена — Янтыковой.

Споров о происхождении немного: тюркская основа очевидна, и альтернативные версии (например, от русского диалектного «янтык» как искажение «янтарь») лишены лингвистической поддержки. Фамилия редкая, её носители, скорее всего, потомки тюркских крестьян или служилых людей, которые в XVI–XVIII веках переселялись в русские земли или принимали православие, меняя фамилию на русский лад. В отличие от более частых фамилий на «-ов», здесь интересна именно основа с тюркским суффиксом, который сохранил память о прозвище, а не об имени.