Фамилия Янушков — редкий случай, когда польская основа оказалась вписана в типично русскую словообразовательную модель. Её ядро — имя Януш, польская и западнославянская форма от Иоанн (в русском обиходе — Иван). В Польше, Чехии и Словакии Януш — полноценное каноническое имя, а не уменьшительное. К нему добавился русский суффикс -ов, который в фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Янушков, то есть сын или потомок человека по имени Януш.

Интересна география фамилии. Она почти не встречается в центральной России, зато заметна в западных областях — Смоленской, Брянской, Псковской, а также в Беларуси. Это следствие многовекового пограничья, где польские имена свободно входили в русский быт через католические и униатские общины, а затем обрусевали с помощью простых суффиксов. В отличие от фамилий на -ский (Янушковский), которые указывают на шляхетское происхождение, Янушков — фамилия крестьянская или мещанская, без сословной претензии.

С точки зрения ономастики, фамилия интересна тем, что сохранила архаичное ударение на первом слоге — Я́нушков, а не Янушко́в. Это выдает её западнорусское происхождение: в говорах тех мест ударение в именах и фамилиях часто смещается к началу слова. Если бы фамилия возникла в великорусских землях, она скорее звучала бы как Янушко́в или вовсе превратилась в Ивашков.

Родственных фамилий немного: Янушевский (польская форма с суффиксом -ский), Янушкевич (белорусская модель с патронимическим -евич) и редкая Янушкин. Янушков стоит особняком — это пример того, как западное имя прижилось в восточнославянской среде без лишних украшений, просто через указание на отца. Носители фамилии, скорее всего, потомки тех, кого в документах записывали как «Янушков сын» — без отчества, по имени деда или отца, что было нормой для сельских общин XVII–XVIII веков.